Dans le domaine de la surveillance, le laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort :
- anime le RNOEA, réseau national d’observations épidémiologiques en aviculture ;
- organise la surveillance annuelle de l’antibiorésistance de Campylobacter chez les animaux de rente. Ce plan de surveillance est mis en œuvre en application des décisions d’exécution 2013/652/UE ;
- co-anime, avec le laboratoire de Lyon, le Résapath, réseau d’épidémiosurveillance de l’antibiorésistance des bactéries pathogènes d’origine animale ;
- contribue à la surveillance programmée de l’influenza aviaire (surveillance sérologique annuelle des virus influenza aviaires et étude des virus influenza aviaires faiblement pathogènes chez le canard) ;
- contribue avec d’autres partenaires de la plateforme d’épidémiosurveilance en santé animale au Résavip, Réseau de surveillance des virus influenza porcins ;
- participe à la surveillance des bactéries zoonotiques (Salmonella, Campylobacter, Listeria, Yersinia et C. botulinum) via la caractérisation de souches issues de contrôles obligatoires, de plan de surveillance et de contrôle, d’enquêtes épidémiologiques et de projets de recherche.
Le laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort est par ailleurs impliqué dans deux des trois plateformes nationales d’épidémiosurveillance :
- la plateforme d’épidémiosurveillance en santé animale (ESA) ;
- la plateforme de surveillance de la chaîne alimentaire (SCA).
Ces missions au sein de ces plateformes sont l’appui transversal sur les différentes thématiques propres au laboratoire, ainsi qu’une participation à des groupes de travail et de suivi, et aux activités de veille sanitaire internationale.